太原海關1987年1月15日建關，建關初期為隸屬于北京海關的正處海關，1989年7月升格為副局，1992年8月改為副局直屬海關，2006年6月升格為正局直屬海關。太原海關下設有同、侯馬、太原機場三個正處隸屬關。總關現有10個處、局、室（辦公室、人教處、政工辦、財務處、綜合業務處、綜合統計處、技術處、稽查處、緝私局、現場業務處）和2個事業單位（機關服務中心、中電子口岸數據中心太原分中心）。